背景
猪瘟(SCF),曾经被称作猪霍乱,是一种世界性的高度接触性传染病,被世界动物卫生组织(OIE)列入OIE疾病名录。19世纪早期就有关于SCF临床暴发的报道,1903年被认定为病毒病。家猪和野猪是SCFV唯一的自然宿主,SCFV流行于欧洲东部地区、亚洲东南部、美国中部及美国南部。尽管欧洲中部地区已从家猪中将SCFV根除,但SCFV仍然在某些野猪群中流行,所以,靠近感染SCFV野猪群的猪场有被重新感染的风险。
病因学
SCFV是相对稳定的RNA病毒,但其抗原性和遗传学变化很大,不同毒株之间还可能进行重组。SCFV不同毒株间的抗原变异可以用单克隆抗体进行鉴定,其遗传变异可通过基因组测序分析。例如采用分别针对E2及Erns糖蛋白的两种单克隆抗体鉴定了21种抗原病毒类型。
对新分离的SCFV毒株的鉴定已有标准化程序,包括基因组片段测序、构建进化树的算法及基因组分类。通常测定病毒基因组的三个区域:3'端聚合酶基因(NS5B);5'非翻译区(NTR)的150个核苷酸及编码E2的190个核背酸。基因型的分类主要依据糖蛋白E2,因该基因序列已公布的数据很多。
SCFV有3个基因群,每一个群有3~4个亚群:1.1、1.2、1.3;2.1、2.2及2.3;3.1、3.2、3.3及3.4。通过对近20年分离毒株的系统发有分析表明,基因群与地理区域有关。基因1群分离株来自于南美及俄罗斯;分离于欧洲西部、中部或东部及一些亚洲国家的毒株大多数属于基因2群;基因3群主要包括来源于亚洲的分离株。位于德国汉诺威的SCF共同体参考实验室建立了一个关于全世界SCFV序列的访问网络数据库。这个数据库对鉴定来源于未曾感染区域的可能引起暴发的病毒非常有用。
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