由于非洲猪瘟,现在大家都开始关注检测了,但是各种真真假假的信息把简单的事情复杂化了。从个人的角度谈谈非洲猪瘟的检测。检测成功有几个重要的要素:样品,方法,检测体系。
1:关于样品:不同的样品在疫病发展的不同的时期,不同的样品类型(血液,组织,拭子,环境等),病毒的含量差异巨大。一方面我们可以通过文献获得,另一方面必须通过临床实践获得。对于活体采样,抗凝血是病毒出现较早,含量高和持续时间长的理想样本。现在大家都在讨论唾液,理想的样本应该是新鲜分泌的口腔液,两者有着本质的区别。口腔液检测的注意事项是,动物实验显示口腔液中病毒早一些,但是病毒含量也较低,对方法的灵敏度要求很高。
2检测方法:对于非洲猪瘟病毒的检测荧光定量pcr方法是目前最稳定,最可靠,试剂成本(不是试剂盒)最低,全球最通用的方法。(荧光的最低检测限<10个拷贝,等温扩增方法比荧光低约10倍,胶体金比等温低约5-10倍,ELISA和胶体金差不多,以上说的是目前市场上最好的产品)。关于OIE的非洲猪瘟荧光pcr方法,好像中国都选择性忽略,是因为商业利益还是技术领先呢?大家可以看看几个国外公司的验证报告,都要做与OIE方法的比较,你可以比oie的方法好,但是要证明到底好在哪里。个人觉得OIE的方法灵敏度是差了一点点,但是稳定性和特异性很好,可以检测所有基因型和在全世界权威参考实验室验证过,可靠性毋庸置疑。大家不要只盯着ct值,谁低谁就好吗(有些公司为了迎合客户已经想到了一些办法)?,谁循环数多就好?谁临界值高就好?按照OIE标准,检测方法的评价常用指标为分析敏感性(最低检测限),分析特异性(交叉反应),重复性,诊断敏感性特异性。好不好用数据说话。现在很多人讨论ct值是多少,都是基于各自的试剂盒和反应体系,换个实验室就没有参考价值了,这实在是很遗憾的。
3检测体系:通常说的人机料法环,检测人员,检测仪器,检测试剂耗材,检测方法,检测实验室和质量控制体系等。我们现在只关注检测试剂盒,但是就算使用了合格的试剂盒,检测结果就准确吗?你的提取试剂合不合格,你的qPCR仪器合不合格,你的人员操作熟练不熟练,你的分子实验室有没有分区,实验中是否有质控?
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