3 临床症状
牛自然感染口蹄疫病毒后潜伏期一般为2－7天，有时可达14天。特征是口、鼻、蹄及乳房等无毛部位出现水疱，水疱破裂后会形成溃疡、结痂，痂块脱落后形成斑痕。其它征状包括沉郁、发热、流涎、跛行。病牛首先是体温升高，精神抑郁，脉搏加快，结膜潮红，反刍减弱。奶牛在沁乳期发病后，产奶量会下降，乳房浮肿、触摸有疼痛感。怀孕奶牛有流产、死胎等症状。新生犊牛发病较急，不形成水疱，表现高热、极度衰弱、心功能紊乱，有时可见腹泻现象，1－2天后会因心肌炎而死亡。部分患病的新生犊牛会不见任何症状而死亡， 剖检可见瘤胃溃疡和心肌炎。
口蹄疫病程和预后会因感染牛的种类、品种、年龄、环境因素、病情等而不同，多数成年牛发病后7－10天全愈。呈良性经过的多数牛，死亡率较低为1－5％，护理条件好的死亡率可下降到0.1－0.2%。幼畜发生口蹄疫而有并发症或继发感染时死亡率较高，冬春寒冷季节，哺乳犊牛患病后死亡率可达5％。当发生恶性口蹄疫后，往往会引起大批患病动物的急性死亡，死亡率可达20－50％。
4 病理变化
奶牛发生口蹄疫后，口腔粘膜及粘膜下组织分离，舌部表皮生发层的上皮细胞坏死、细胞间水肿和粒细胞浸润。咽部、气管、支气管和前胃粘膜有时可见到圆形烂斑、溃疡，真胃和肠粘膜可见弥散性或点头出血，心肌松软，心肌纤维坏死，心肌切面有灰白色条纹和斑点，称“虎斑心”。 牛典型性口蹄疫发病分四个阶段：浆液性渗出阶段（原发性水疱阶段）， 病毒血症阶段，继发性水疱阶段，转归阶段。
5 诊断
根据口蹄疫的急性经过，呈流行性传播，一般根据临床症状先做初步判断，根据病理变化作进一步判断，确诊需经实验室诊断。
5.1 病原学诊断
5.1.1 样品采集及注意事项
采集样品包括：水疱皮（液）、食道咽部刮取物（O/P液）、血样等，或组织、脏器、分泌物、排泄物等，或副产品如肉制品、奶制 品和皮制品等。
样品采集时或采集后注意事项包括：采样要及时，水疱期采样为最佳；采样要准确，根据检验目标的不同而采集不同的样品，如采集病原诊断样品要选典型病变部位的水疱皮、水疱液等；样品要洁净，按无菌要求操作，采样工具要灭菌，采样部位要用水冲洗干净；样品量要足，数量要够，且要有备份；采样或送样时要注意安全保护；样品要保持新鲜，在数小时内送检或暂时冷藏或冷冻保存，必须24h内 送达检验室；妥善包装密封，做好标识；检验在有资质的单位进行。
5.1.2 病毒分离
病毒分离是口蹄疫诊断的最可靠证据。按实验手册进行。初代小牛甲状腺细胞(CTY)对 FMDV 最敏感，初代小牛、羔羊和猪肾细胞也比较敏感，猪肾细胞系IBRS-2、PK-15和仓鼠肾细胞系 BHK-21等传代细胞系也能分离病毒。2-7日龄的乳鼠也常用于分离FMDV，但敏感性较低。乳鼠接种FMDV后(24-72h)，出现典型症状，表现为四肢麻痹、呼吸困难而死。
5.2 血清学诊断
5.2.1 抗原鉴定
检测样品中是否存在口蹄疫抗原或核酸，对阳性样品还须明确其血清型。抗原鉴定的方法很多，主要包括补体结合试验(CFT)、病毒中和实验(VNT)、反向间接血凝试验(RIHA)、间接夹心ELISA (IS-ELISA)、RT-PCR技术和核酸序列分析。ELISA检测法是目前常用且效果最好的方法。
5.2.2 抗体检测
通过检测动物体液中的(主要是血清)特异性抗体，可对FMDV感染与免疫状况作出诊断。抗体的检测方法包括补体结合试验(CFT)、病毒中和实验(VNT)、凝集试验、免疫扩散、放射免疫试验和ELISA等，其中最常用于检测FMDV抗体的方法是病毒中和实验和ELISA方法，这两种方法也是国际贸易中指定的使用方法。
5.3 鉴别诊断
5.3.1 与其它疫病的鉴别
牛口蹄疫与牛瘟、牛恶性卡他热、传染性水疱性口炎、牛的流行性胃炎、牛疮疹性乳头炎、传染性鼻炎、真菌病和蓝舌病等疫病部分临床 症状有相似之处，在诊断时应认真鉴别。一般情况下，实验室诊断时分离鉴定出相应的病毒或病毒特异性抗原、检测到病毒特异性抗体可做出区分。
5.3.2 自然感染和人工免疫的鉴别
目前，临床上使用的口蹄疫苗主要为灭活苗，制苗过程中大部分病毒非结构蛋白已被去除。免疫动物后，病毒不会在牛体内增殖，也就不会产生非结构蛋白，也就不会产生相应的抗体。根据此蛋类蛋白可作该类鉴别。近年研究结果，非结构蛋白3AB和3ABC的抗体检测是最可靠的指标，国内外已有相关的检测方法，如NSP－3ABC－ELISA技术。
5.4 诊断结果判定
5.4.1 疑似口蹄疫
符合该病的流行病学特点和临床诊断或病理诊断指标之一，即可定为疑似口蹄疫病例。
5.4.2 确诊口蹄疫病例
疑似口蹄疫病例，病原学检测方法任何一项阳性，可判定为确诊口蹄疫病例；疑似口蹄疫病例，在不能获得病原学检测样本的情况下，未免疫家畜血清抗体检测阳性或免疫家畜非结构蛋白抗体ELISA检测阳性， 可判定为确诊口蹄疫病例。
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