除了家猪和人类之外,已证明猪流感病毒也感染野猪、家养火鸡以及在罕见的情况下感染放养水禽。

在实验条件下,猪能被多种亚型的禽流感病毒感染,并且禽流感病毒自然感染猪的病例在世界范围内也有记载。例如,已从加拿大或亚洲猪体内分离到HIN1, H3N2,H3N3及H4N6病毒以及从亚洲猪体内分离到H5N1和H9N2病毒。这些由禽到猪的传播在流行病学上通常以死亡告终,不会在猪群中继续传播。这与实验研究结果一致,表明禽流感病毒在猪体内复制及在猪群中传播的限制性。因此,禽流感病毒必须突变或与适应猪的病毒发生重组才能在猪体内有效复制,且禽源与猪源病毒基因的重组已在猪体内建立。事实上,欧洲的禽源猪流感HINI病毒是唯一的适应猪的完全禽源病毒。

人流感病毒偶尔也能从猪体内分离到。尤其是人源H3N2病毒经常从亚洲猪体内分离出来,而在欧洲及北美洲猪体内偶尔也能分离到。如禽流感病毒一样,人源流感病毒在猪之间的有效传播似乎需要适应新的宿主。因此,北美及欧洲猪群中保持的H3N2病毒是人源及适应猪的基因混合重组。

猪源HA抗原漂移通常比人类HA抗原漂移慢。例如,最近欧洲猪流感H3N2病毒仍然与20世纪70年代和80年代的人源病毒的抗原性有关,而当前人源病毒已与其祖先渐渐产生漂移。有趣的是,人源与猪源病毒HA基因进化速度似乎相似,但猪源病毒明显在对免疫反应不太重要的区域发生突变。然而,需要全面分析不同的猪流感病毒谱系的遗传和抗原性以及与人类谱系进行比较,以充分了解猪流感病毒的漂移及其对免疫反应的意义。

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